Моделі з атмосферним двигуном 2JZ-GE мали позначення JZS160, амоделі з двигуном 2JZ-GTE з подвійним турбонаддувом. JZS161 такийже мотор ставився на турбовані версії Toyota Supra a80 з 1996 рокувипуску для внутрішнього ринку Японії.Система зміни фазгазорозподілу VVT-i тепер йшла в стандарті.Для версій з подвійнимтурбонаддувом були доступні такі опції, як всі поворотні задніелектропідрулюючі колеса(4w system), ARS, система курсовоїстійкості VSC і автоматична КПП з ручним секвентальнимрежимом.Повнопривідних версій виробник не пропонував.Дизайн новоїмоделі створювався вдома, в Японії, і слідував моді купе Lexus SC -мав чотири роздільні фари.Коефіцієнт лобового опору становивCx0.Lexus вперше було запропоновано електролюмінісцентне підсвічуванняприладів, а також нову аудіосистему. Відповідаючи зростаючимзапитам американського ринку, була запущена нова модифікація GS400, яка мала на озброєнні 300-сильний 4-літровий V8 двигунUZ-series. З ним автомобіль набирав заповітні 60 миль/год (96км/год) за 5.4 сек (за даними Edmunds.com). Також пропонуваласяспокійніша версія нового покоління GS 300 з рядним 6-циліндровим3-літровим двигуном потужністю 228 к.С. Від 0 до 60 миль/годавтомобіль розганявся за 7.6 с. Обидві моделі укомплектовувалися5-ступінчастими АКПП, а модель GS 400 мала кнопки перемиканняпередач на рульовому колесі. І знову не було запропоновано«заряджених» турбо-моделей для зовнішніх ринків. Порівняно зі своїмпопередником, друге покоління седана GS досягло більшого успіху, продававшись за перший рік у кількості 30 622 автомобіля. Успіхмоделі переконав керівництво тримати її в модельному ряду протягом8 років. В 2001 році модель зазнала єдиного рестайлінгу в другомупоколінні. Зміни зазнали передня та задня оптика, а також переднярешітка радіатора. Ксенонове світло фар стало стандартом длядвигуна V8 та опцією для 6-циліндрового двигуна. Усерединіз'явилося ще більше дерева, а кнопки перемикання передач на кермітепер і в моделі GS 300. У 2001 році двигун V8 додав додаткові 0.3літри робочого об'єму і модель стала називатися GS 430. Максимальнапотужність не зросла, зате збільшився момент, що крутить.
У 2001 році Lexus також випустив обмежену серію автомобіля GS300 «SportDesign», обладнаного спортивною підвіскою як у моделі GS430, спортивними покришками 225/55VR-16 Michelin Pilot HX таполірованими колісними дисками. У салоні додалася перфорованашкіряна обшивка та оздоблення шліфованим алюмінієм темним деревомгоріха. До літа 2001 року було випущено лише 3300 одиниць GS 300SportDesign (проти 25000 автомобілів загальної серії). Виробництволімітованої серії тривало до 2005 року. Седан GS був удостоєнийтитулу авторитетного автомобільного видання Motor Trend's —найкращий імпортний автомобіль 1998 року (Import Car of the Yearfor 1998). Це також зазначив журнал Car and Driver у своємурейтингу десятки найкращих автомобілів з 1998 по 2000 рік (Ten Bestlist 1998—2000)
