Модель була представлена громадськості у вересні 1995 року наавтосалоні у Франкфурті. Зміни в дизайні порівняно з попереднімпоколінням (BMW E34) були більш значними, ніж за попередніх змінпоколінь. Загалом кузов став меншим кутастим, фірмові подвійні фарибули закриті загальним плафоном, окантовка решітки радіатора(«ніздрі») придбала більш округлу форму.Центральна консольавтомобіля, як і в попередніх поколіннях, трохи повернена у бікводія. Підвіска автомобіля майже повністю зроблена з алюмінію (завинятком моделей з моторами V8, де використовується чавун), щодобре вплинуло на керованість автомобіля, зменшивши його вагу.безпружинна маса підвіски зменшилася на 36% і, як наслідок, підвіска стала комфортнішою.Для кращого розподілу ваги автомобіляпо осях акумулятор розташували в підпіллі багажного відділення.
< /p>
Навесні 1997 року побачив світ універсал Touring, який на 90 ммдовший за седан і на 100 кг важчий, при цьому він зберіг кращідрайверські якості седана. Гамма двигунів повністю ідентичнаседану, а список стандартного оснащення був доповнений двомабічними подушками безпеки. У 1998 році почалося виробництво BMW M5.На цей автомобіль встановлювали форсований 5-літровий двигун V8S62, конструктивно схожий із серійним 4, 4-літровим агрегатомM62B44, обладнаний системою Double-VANOS та вісьмомаіндивідуальними дросельними заслінками. Вперше на серійній моделіBMW потужність двигуна досягла 400 л. Але на відміну від BMW E34, не з'явився M-універсал на базі E39. Єдиний у світі офіційний BMWM5 E39 touring замовив глава BMW M GmbH. У 1999 році модельотримала частину конструктивних змін, які торкнулися двигунів, і невплинули на дизайн автомобіля. Основні зміни полягали в тому, що6-циліндрові мотори отримали керування обома розподільними валамисистеми Double-VANOS, 8-циліндрові - систему VANOS для впускнихклапанів та двоступінчасті каталітичні нейтралізаторивідпрацьованих газів, що дозволили задовольнити вимогам Euro 4 2005року.
У тому ж 1999 році з'явився 184-сильний дизель з нерозділеноюкамерою згоряння, системою упорскування Common Rail, турбонаддувомі проміжним охолодженням повітря на моделі BMW 530d. Автомобільздатний розвивати 225 км/год і витрачати в стандартному заміськомуциклі менше 6 л/100 км. Наприкінці 1999 року на російських дорогахз'явилися перші автомобілі BMW E39, зібрані для підприємства АТ«Автотор» у Калінінградській області. Ціна «російських» BMW E39була приблизно на 10 тис. Доларів нижчою за «німецькі».безпосереднього упорскування. Його потужності (136 к.С.) цілкомвистачало, щоб навіть 1, 6-тонну 5-ку Touring розганяти з місця до100 км/год за 10, 9 с.
Більш потужна BMW 525d замінила попередницю 525tds зпередкамерним 143-сильним дизелем. Новий 2, 5-літровий 6-циліндровийдизель безпосереднього упорскування з турбонаддувом оснащенийсистемою паливоподачі Common Rail і розвиває 163 к.С. У вересні2000 року BMW E39 зазнала рестайлінгу . Зовнішньо оновлену п'ятіркуможна легко дізнатися за оригінальною світлотехнікою виконаною затехнологією CELIS, бамперам і округлим дзеркалам. Однак головнізміни приховані всередині - тут з'явилися відразу три нові двигуниM54 для моделей BMW 520i, 525i та 530i. Всі вони рядні, 6-циліндрові, із системою Double-VANOS. Перший двигун для BMW 520iстворений на базі старого 2-літрового агрегату. Збільшення ходупоршня з 66 до 72 мм, дозволило збільшити робочий об'єм з 1991 до2171 см і максимальну потужність з 151 до 170 к.С. При 6250 об/хв.Другий двигун - це колишній 2, 5-літровий агрегат моделі BMW 523i, але в модернізованому варіанті розвиваючий вже не 170, а 192 к.С. (індекс 523i замінили на правильний 525i). Третій двигун для BMW530i, вперше, в середині 2000 року, з'явився на моделях 3-ї серії -це 3-літровий двигун з великою потужністю 231 к.С. > Доконструктивних особливостей моделі відносять гідронаповненісайлентблоки, які краще гасять вібрації, але досить швидкозношуються. Деякі виробники неоригінального автоустаткування, наприклад Wulf Gaertner Autoparts AG, випускають більш довговічніцільногумові сайлентблоки1. Модель випускалася до 2003 року, колиїї змінила BMW E60. BMW M5 E39 випускалася до 2004 року, коли їїзмінила BMW M5 E60. Універсали також випускалися до 2004 року.Модель Циліндри Потужність Крутний момент Дата випуску Кодмотора
520i 6 150 к.С. 191 Nm 1996 по 1999 M52B20
520i 6 157 к.С. 190 Nm 1998 по 2000 M52TUB20
520i 6 170 к.С. 210 Nm 2001 по 2003 M54B22
523i 6 174 к.С. 245 Nm 1995 по 1998 M52B25
523i 6 170 к.С. 245 Nm 1998 по 2000 M52TUB25
525i 6 192 к.С. 245 Nm 2001 по 2003 M54B25
528i 6 193 к.С. 280 Nm 1996 по 1998 M52B28
528i 6 193 к.С. 280 Nm 1998 по 2000 M52TUB28
530i 6 231 к.С. 300 Nm 1999 по 2003 M54B30
535i 8 235 к.С.