Представлений у 2004 році автомобіль Škoda Octavia другогопокоління був створений на платформі Volkswagen Group A5 (PQ35).Машина отримала нову лінійку моторів, новий дизайн кузова.
У 2007 році з'явився позашляховий варіант — повнопривіднийуніверсал Škoda Octavia Scout зі збільшеним дорожнімпросвітом.
У 2009 році оновили дизайн, дані моделі отримали приставку FL уназві.